毫無(wú)疑問(wèn),自16世紀(jì)以來(lái),光學(xué)顯微鏡已經(jīng)歷漫長(zhǎng)的旅程。首次被知曉的復(fù)合顯微鏡是由Zacharias和Hans Janssen構(gòu)造的。盡管這些顯微鏡沒(méi)有保存下來(lái),但人們確信這些顯微鏡已能夠?qū)⒎糯蟊堵蕪?倍提高到9倍。17世紀(jì)末期,Leeuwenhoek首次將放大倍率和分辨率提高到細(xì)胞水平。他存留下來(lái)的顯微鏡有275倍的放大倍率和令人震驚的1μm分辨率。在19世紀(jì)晚期,Ernst Abbe發(fā)現(xiàn)光學(xué)顯微鏡的分辨率是由入射光波長(zhǎng)和顯微鏡數(shù)值孔徑的函數(shù)關(guān)系決定的。這一發(fā)現(xiàn)使分辨極限達(dá)到220nm左右。在之后的約100年內(nèi),顯微鏡學(xué)家始終停留在這一分辨極限??臻g分辨率的限制排除了光學(xué)顯微鏡分辨亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)如核糖體、囊泡以及其他分子相互作用的可能性,這些物質(zhì)尺寸均在光學(xué)顯微鏡的分辨能力之下。
20世紀(jì)30年代后期,德國(guó)科學(xué)家Ernst Ruska發(fā)明了電子顯微鏡,它的出現(xiàn)并不久,而Max Knoll推動(dòng)其分辨率極限低至10埃左右。這是一個(gè)不可思議的壯舉。不幾年后,生物學(xué)家就開(kāi)始利用這種新型的工具。1945年3月,Keith Porter, Albert Claude和Ernest Fullam 在論文“電子顯微鏡用于組織培養(yǎng)細(xì)胞的研究”中發(fā)表了**張單個(gè)細(xì)胞的電子顯微鏡照片,文章發(fā)表在Journal of Experimental Medicine上。接下來(lái)的幾十年涌現(xiàn)出大量由生物學(xué)家利用TEM揭示詳細(xì)和復(fù)雜超微結(jié)構(gòu)的實(shí)驗(yàn)工作。
然而,生物顯微鏡的目的是了解細(xì)胞存活時(shí)如何發(fā)揮機(jī)能?!凹?xì)胞生命”則是科學(xué)家為得到TEM驚人分辨率所需付出的代價(jià)。細(xì)胞樣品要求被固定、脫水、包埋于塑型劑并切成超薄切片。這就產(chǎn)生了一個(gè)高度加工和*終長(zhǎng)時(shí)間操作的樣品的二維圖像。我們花了很長(zhǎng)時(shí)間尋找合適的固定劑和緩沖劑,以*大限度地減少人工操作。同樣,利用超薄連續(xù)切片,目前三維的細(xì)胞重構(gòu)也成為可能,但數(shù)據(jù)仍然僅呈現(xiàn)一個(gè)快照的時(shí)間。而生命是動(dòng)態(tài)的,它的周期超過(guò)一個(gè)快照的時(shí)間。
接下來(lái)這一領(lǐng)域出現(xiàn)了超高分辨率顯微鏡。為充分認(rèn)識(shí)動(dòng)態(tài) 生命進(jìn)程,我們需要推進(jìn)光的分辨率極限,并將熒光和共聚焦成像的先進(jìn)技術(shù)應(yīng)用于亞細(xì)胞水平。我們需要能夠應(yīng)用于活細(xì)胞的更高分辨率。1978年,兄弟Thomashe和Christopher Cremer兩人在Microscopia Acta上發(fā)表了“對(duì)具有高分辨率和穿透深度的激光掃描顯微鏡的思考”。文章中的觀測(cè)數(shù)據(jù)開(kāi)啟了在光的衍射極限之下的觀測(cè)的大門。
超高分辨率顯微鏡的代表技術(shù)包括:STED,PALM,STORM,SIM;所有主要的顯微鏡供應(yīng)商,如萊卡、蔡司和尼康,均提供商品化超分辨率顯微鏡部件,分辨率低至20納米并非罕見(jiàn)的要求。即使是規(guī)模較小運(yùn)營(yíng)不久的公司,如猶他州的Vutara,號(hào)稱有**款3D超分辨率顯微鏡,也進(jìn)軍這一領(lǐng)域。這一分辨水平的活細(xì)胞成像變的十分普遍,在大量文獻(xiàn)中都能看到。
1873年,德國(guó)醫(yī)師Ernst Abbe 提出了“衍射極限”的概念。他預(yù)測(cè),由于光的基本衍射性質(zhì),光學(xué)顯微鏡無(wú)法實(shí)現(xiàn)200nm以下的分辨率。實(shí)際上,當(dāng)兩個(gè)相隔很近的物點(diǎn)同時(shí)發(fā)光時(shí),得到的圖像是模糊的,無(wú)法分辨。超分辨率顯微鏡(SRM)的誕生打破了一個(gè)世紀(jì)多以來(lái)一直被認(rèn)為無(wú)法突破的瓶頸。
如今,科學(xué)家們已經(jīng)研發(fā)了多種超分辨率技術(shù),遠(yuǎn)遠(yuǎn)超出了衍射極限,能夠觀察到分子尺度的細(xì)節(jié)。SRM技術(shù)可以將細(xì)胞結(jié)構(gòu)解析為亞細(xì)胞水平,從而獲取有關(guān)細(xì)胞組分的3D結(jié)構(gòu)的信息,并可以觀察到單分子共定位。
以下概述了時(shí)下幾種*流行的SRM技術(shù)的原理:
1.受激發(fā)射耗竭(STED)顯微鏡
STED對(duì)于有經(jīng)驗(yàn)的熒光顯微鏡使用者來(lái)說(shuō)相對(duì)簡(jiǎn)單,該方法和普通共聚焦顯微鏡(Confocal)的原理相同。普通Confocal使用單光源,而STED使用雙光源。其中一個(gè)光源發(fā)射能激發(fā)熒光團(tuán)——熒光標(biāo)簽(研究者們以此來(lái)定位和觀察蛋白)的光,另一個(gè)光源發(fā)出不同波長(zhǎng)的光,用于抑制熒光。這束光是環(huán)形的,并且與**束光有所重疊,因此只有環(huán)形中間區(qū)域的分子會(huì)繼續(xù)發(fā)出熒光。
獲得STED超分辨率圖片并沒(méi)有那么復(fù)雜,用戶需要仔細(xì)調(diào)整參數(shù),才能得到漂亮的結(jié)果,否則所得圖片和普通confocal沒(méi)有差別。
使用傳統(tǒng)和RESCue受激發(fā)射減損顯微鏡(STED)得到的細(xì)胞核膜上核孔復(fù)合體的圖片
STED的原理:
顯微鏡透鏡對(duì)光的衍射會(huì)導(dǎo)致來(lái)自單個(gè)點(diǎn)的光出現(xiàn)在較大的區(qū)域,這稱為點(diǎn)擴(kuò)散函數(shù)(PSF)(見(jiàn)圖1),由于PSF的存在,使得常規(guī)顯微鏡無(wú)法達(dá)到超分辨。
圖1:在普通光學(xué)顯微鏡中,成像是通過(guò)將來(lái)自點(diǎn)光源的光線會(huì)聚到像平面上的單個(gè)點(diǎn)來(lái)實(shí)現(xiàn)的。超出光衍射的限制,防止了射線的精確會(huì)聚,從而導(dǎo)致物體的圖像模糊。顯微鏡的分辨率取決于點(diǎn)擴(kuò)散函數(shù)(PSF)的大小,或?qū)ο笤谀硞€(gè)點(diǎn)的三維強(qiáng)度分布。在STED中,應(yīng)用環(huán)形炸彈耗盡型激光器,其零點(diǎn)與激發(fā)激光焦點(diǎn)的*大值重疊。STED激光器引起熒光的“飽和耗盡”,從而“抑制了來(lái)自零點(diǎn)附近區(qū)域的熒光,導(dǎo)致有效PSF的尺寸減小”。
而受激發(fā)射耗竭(STED)顯微鏡通過(guò)限制樣品的熒光區(qū)域(PSF)產(chǎn)生超分辨率圖像。STED顯微鏡使用兩個(gè)重疊的激光,**個(gè)按照常規(guī)顯微鏡激發(fā)熒光團(tuán)(圖2A)。第二個(gè)激光器稱為耗盡激光器(STED激光器),它激發(fā)“甜甜圈”形狀的激光,其中心的零強(qiáng)度點(diǎn)非常小(?30 nm)(未激發(fā))。除了在甜甜圈的中心處之外,第二激光起到了“關(guān)閉”**激光所產(chǎn)生的外圈熒光,從而將樣本激發(fā)的熒光分子范圍縮小到中心圓點(diǎn)處,這有效地降低了PSF,以產(chǎn)生非常小的單分子熒光聚焦區(qū)域,從而獲得高分辨率圖像(圖2D)。
圖2:
單個(gè)小于250 nm的蛋白質(zhì)無(wú)法通過(guò)標(biāo)準(zhǔn)共聚焦成像解析,從而導(dǎo)致圖像模糊
STED耗盡激光器產(chǎn)生了淬滅外圍熒光的“甜甜圈”
飽和耗盡在功能上降低了激勵(lì)PSF
隨之可以解析單個(gè)蛋白質(zhì)
適用于STED的熒光團(tuán)偶聯(lián)抗體:
為了獲得超分辨率,染料必須具有STED激光波長(zhǎng)的高發(fā)射截面,并有效地實(shí)現(xiàn)高飽和度。這種強(qiáng)烈的照明確保了所有被STED激光“關(guān)閉”的分子都受受激發(fā)射的支配。合適的染料應(yīng)具有低的光漂白性,具有高的量子產(chǎn)率和對(duì)比度,并在目標(biāo)附近具有足夠的標(biāo)記密度。
Jackson提供熒光染料標(biāo)記的二抗,下列染料標(biāo)記的二抗已被驗(yàn)證在STED中成功使用: AlexaFluor?488(如:115-545-003),F(xiàn)ITC(如:715-095-150),AlexaFluor?594(如:715-585-151)和AlexaFluor?647。
2. 隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡(STORM)
*有名的“基于探針”的技術(shù)是Betzig等人研發(fā)的光激活定位顯微技術(shù)(photoactivated localization microscopy, PALM)和哈佛大學(xué)莊小威實(shí)驗(yàn)室發(fā)明的隨機(jī)光學(xué)重建顯微技術(shù)(stochastic optical reconstruction microscopy, STORM)。*初所有的熒光標(biāo)簽都是暗的。然后使用激光脈沖來(lái)激活一小部分熒光標(biāo)簽,隨后使用另一束光來(lái)關(guān)閉這些熒光標(biāo)簽。不斷重復(fù)這個(gè)過(guò)程,生成一系列部分熒光圖,*后重建成整個(gè)視野的熒光圖。,以產(chǎn)生分辨率優(yōu)于常規(guī)方法收集的圖像。
使用超分辨率隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡(stochastic optical reconstruction microscopy,STORM),科學(xué)家首次觀察到了神經(jīng)元軸突的細(xì)胞骨架。
Jackson提供適用于dSTORM應(yīng)用的標(biāo)記二抗,簡(jiǎn)而言之,較低強(qiáng)度的激發(fā)光激發(fā)樣品,隨機(jī)激活少量染料分子。單個(gè)發(fā)熒光的染料分子足夠分散,因此可以計(jì)算其點(diǎn)擴(kuò)散函數(shù)的中心,從而推斷出染料的確切位置。然后使用第二激光關(guān)閉所有分子,并重復(fù)該過(guò)程。然后,通過(guò)重疊每種染料的所有映射點(diǎn)擴(kuò)展函數(shù),以數(shù)學(xué)方式生成高分辨率圖像。
用于單分子定位實(shí)驗(yàn)的熒光團(tuán)偶聯(lián)抗體
用于單分子定位的*佳染料通常非常亮,并產(chǎn)生足夠的光子以可靠地產(chǎn)生緊密的高斯分布。Jackson ImmunoResearch提供了多種廣譜范圍內(nèi)的可靠染料,例如AlexaFluor 488,AlexaFluor 647和Cy 5,可用于這些類型的實(shí)驗(yàn)。
建議用于超分辨率顯微鏡的熒光染料偶聯(lián)物:
STED | 激發(fā)波長(zhǎng)(nm) | 發(fā)射波長(zhǎng)(nm) |
Alexa Fluor 488 | 493 | 519 |
熒光素 / FITC | 492 | 520 |
Alexa Fluor 594 | 591 | 614 |
Alexa Fluor 647 | 651 | 667 |
STORM | 激發(fā)波長(zhǎng)(nm) | 發(fā)射波長(zhǎng)(nm) |
Alexa Fluor 488 | 493 | 519 |
Alexa Fluor 647 | 651 | 667 |
Cy5 | 650 | 670 |
每種SRM技術(shù)都有各自的探針選擇要求,Jackson ImmunoResearch提供多種已知在SRM應(yīng)用中表現(xiàn)良好的熒光標(biāo)記二抗。應(yīng)該注意的是,SRM領(lǐng)域變化迅速,因此,建議從專業(yè)技術(shù)文獻(xiàn)中尋求信息,以幫助選擇合適的熒光團(tuán)。